塑料托盘仓储计划纸箱通过3条通道从合并前的积放点到达合并主道，每条通道的处理速度大约是每分钟15个纸箱这些纸箱以较慢的速度开始合并，而以较快的速度即每分钟45个纸箱被输出。此时分拣和合并操作被捆绑在一起，综合分拣子系统开始工作。ISS实时监控分拣子系统，并根据输入货箱的数量决定到底是该加速还是减速。为了实现这一功能，合并和分拣之间的整个系统需要变速驱动机制以精确地控制传送带进行加速或者减速，变频驱动器通过控制供给马达的电力来调节交流电动机的转速。在整个分拣子系统上我们都能实现可变的速度。”JCPenney物流设施工程部经理TimWood说，“我们能够设定任何想要的速度。如果知道今天的处理量不多，我们可以将传送带的速度调至300英尺每分钟；如果处理量很大的话，就将其调到500英尺每分钟。这种速度变化不仅能够节省电力，还非常有助于减少设备的磨损。毕竟传送带运行速度是300英尺每分钟还是500英尺每分钟，在维护时完全不是一个等级。
　　精确地控制间距是整个分拣系统的核心。纸箱在退出合并通道时速度是每分钟4s个纸箱。但是在合并以后，一切都要以分拣的速度为准。Lathrop物流中心的分拣速度大约为每分钟238个纸箱，这与之前的速度可谓天差地别。德马泰克FlexGap感应系统主要用来将纸箱之间的间距缩小到1～2英寸，而其他分拣系统纸箱的间距一般为12～14英寸。纸箱空间距离的减少使系统能够在分拣前集聚更多的纸箱。 纸箱间距的设定采用可变频率的交流驱动器来实现，这一点和整个分拣子系统用来完成对传送带的精确控制如出一辙。每个马达独立地驱动一条传送带，所以不存在齿轮减速的问题，这样能够很好地控制传送带之间速度变化的比率，这就意味着更精确的间距控制。同时，系统在传统脉冲位置指示器的位置上使用横向阵列传感器来进行间隔塑料托盘仓储，前者主要用在数码相机图像传感上，这就使得整个间距设定过程更加精确。此外，系统使用固体光电检测阵列实时监控货物，其中光电检测器之间的间隙小至2mm。由于系统实时监控，可以随时调整传送带的速度，更精确地控制货物的间距。